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光学性能：聚合物盖玻片底部或玻璃底部，均具有高光学质量。聚合物盖玻片底部的折射率（nd 589nm）为 1.52，阿贝数 56，厚度 180μm（#1.5），在高分辨率显微镜下能提供清晰图像，且自发荧光低，对细胞成像干扰极小 。玻璃底部（如用于特定应用的 1.5h 玻璃盖玻片，厚度 170μm±5μm）同样具备出色光学性能，适用于全内反射荧光（TIRF）、单分子及超分辨率显微镜等成像技术 。
理想细胞生长环境：经 ibiTreat 处理的表面为细胞提供了良好的粘附与生长条件，多数贴壁细胞无需额外包被即可在此表面良好生长 。对于有特殊需求的细胞培养，还可进行细胞外基质（ECM）蛋白包被。而未处理的疏水表面，可用于需特定包被的贴壁细胞培养；bioinert 表面则阻止细胞粘附，适合悬浮细胞、细胞聚集体、球体及类器官培养 。
减少蒸发设计：培养皿盖子设有锁扣位置，能有效减少液体蒸发，为在非加湿环境下的长期细胞培养与研究提供稳定条件。同时，培养皿采用透气塑料材质，确保细胞培养过程中二氧化碳和氧气等气体的正常交换 。
操作便捷与通用性：标准 35mm 直径规格，方便操作与适配各类实验室设备 。高壁设计不仅增加了培养容积（2ml），还便于日常使用时的拿取与操作 。此外，该培养皿与所有染色和固定溶剂兼容，可满足多种细胞实验需求。
细胞培养与成像：适用于各类细胞系的培养，以及原代细胞培养 。结合其高分辨率成像能力，可用于免疫荧光染色后细胞的宽场和共聚焦荧光显微镜观察，也适合活细胞的长时间成像研究，实时监测细胞生长、增殖、分化等动态过程 。
转染实验：为细胞转染提供稳定的培养环境，可通过后续成像或分析技术，评估转染效率与转染后细胞的功能变化 。
细胞定位与计数：带有 500µm 网格（如 µ-Dish 35 mm, high grid - 500）的版本，便于对细胞或细胞簇进行定位，在计算转染效率、统计特定区域内细胞事件数量等实验中发挥重要作用 。
特殊显微镜应用：使用特殊 DIC 盖子，可用于微分干涉相差（DIC）显微镜观察 。玻璃底部的培养皿版本，特别适用于 TIRF、单分子应用以及超分辨率显微镜（如 STED、SIM、(F) PALM、(D) STORM）和荧光相关光谱（FCS）等显微镜技术 。
培养皿检查：收到培养皿后，检查包装是否完好，单个培养皿有无破损、污染迹象 。确认产品规格、表面处理类型（如 ibiTreat、uncoated、bioinert 等）是否与实验需求相符 。
试剂与耗材准备：
细胞培养基：根据所培养细胞类型，选择合适的培养基，并添加相应的血清、抗生素、生长因子等成分 。培养基需提前过滤除菌，确保无菌状态 。
细胞：复苏冻存细胞或从培养瓶中消化获取对数生长期细胞，制成细胞悬液 。通过细胞计数确定合适的接种密度。
其他耗材：准备无菌移液器吸头、移液管、离心管、镊子等耗材，所有耗材需保证无菌 。若需对培养皿进行额外包被（如使用 ECM 蛋白包被未处理表面的培养皿），准备相应包被试剂 。
ibiTreat 表面培养皿：对于需在 ibiTreat 表面培养的细胞，直接将适量细胞悬液加入培养皿中 。例如，若细胞接种密度为每平方厘米 1×10⁵个细胞，对于生长面积 3.5cm² 的 µ-Dish 35 mm 高壁培养皿，可加入含有 3.5×10⁵个细胞的细胞悬液 。轻轻晃动培养皿，使细胞均匀分布，避免产生气泡，然后将培养皿放入 37℃、5% CO₂的细胞培养箱中孵育 。
未处理表面培养皿（若需包被）：若使用未处理的疏水表面培养皿且需进行 ECM 蛋白包被，先将包被试剂（如多聚赖氨酸、纤连蛋白等）稀释至合适浓度 。取适量稀释后的包被试剂加入培养皿，确保液体均匀覆盖底部表面，室温孵育 1-2 小时或按照试剂说明书要求的时间孵育 。孵育结束后，用无菌 PBS 冲洗培养皿 2-3 次，去除未结合的包被试剂，然后进行细胞接种，接种方法同 ibiTreat 表面培养皿 。
bioinert 表面培养皿：对于培养悬浮细胞、球体或类器官的 bioinert 表面培养皿，直接将细胞悬液或含有细胞聚集体的溶液加入培养皿 。同样轻轻晃动使分布均匀后放入培养箱 。由于细胞不会粘附在 bioinert 表面，在操作和观察过程中需注意避免溶液过度晃动导致细胞聚集体位置改变 。
日常培养：将接种细胞后的培养皿放入细胞培养箱，定期观察细胞生长状态 。根据细胞生长速度，每隔 1-2 天更换一次培养基，去除细胞代谢产物，补充营养物质 。观察细胞时，可在倒置显微镜下直接观察培养皿中的细胞，注意细胞形态、密度变化等 。
显微镜成像：
荧光显微镜成像：若进行荧光染色实验，当细胞生长至合适阶段，按照免疫荧光染色流程进行操作 。包括固定细胞（如使用 4% 多聚甲醛固定 15-20 分钟）、通透处理（0.1% Triton X-100 处理 10 分钟）、封闭（5% BSA 封闭 30 分钟）、一抗和二抗孵育等步骤 。染色完成后，用 PBS 清洗干净，直接在荧光显微镜下观察 。由于 ibidi µ-Dish 35 mm 高壁培养皿底部的低自发荧光特性，可获得清晰的荧光图像 。
其他显微镜成像：如需进行 TIRF、DIC 等特殊显微镜成像，根据相应显微镜的要求，将培养皿放置在配套的载物台上 。对于需使用特殊盖子（如 DIC 盖子）的实验，在成像前更换为相应盖子 。调整显微镜参数，获取高质量的细胞图像 。
废弃物处理：实验结束后，含有细胞的培养基、一次性耗材等废弃物，按照生物安全废弃物处理规范进行处理 。对于可能含原体或危险生物材料的废弃物，需先进行高压灭菌或化学消毒处理，然后丢弃 。
培养皿处理：若培养皿为一次性使用产品，直接丢弃至相应废弃物容器 。若培养皿可重复使用（但需确认产品说明是否支持），先将培养皿中的液体倒出，用清水冲洗干净，然后浸泡在合适的清洁剂溶液中，超声清洗去除残留细胞和杂质 。清洗后用蒸馏水冲洗多次，烘干备用 。但需注意，重复使用可能会影响培养皿的性能，尤其是底部的光学性能和表面特性，对于对实验精度要求的实验，建议使用新的培养皿 。
培养皿储存：未使用的培养皿应储存在干燥、清洁的环境中，避免阳光直射和高温 。对于已开封但未使用完的培养皿，需密封保存，防止灰尘和微生物污染 。
操作过程无菌要求：在整个细胞培养和实验操作过程中，严格遵守无菌操作规范 。在超净工作台中进行操作，使用前用 75% 酒精擦拭台面和双手，对使用的耗材、试剂等进行表面消毒 。避免交叉污染，不同细胞系或实验的操作应分开进行，使用不同的移液器和耗材 。
盖子锁扣使用：当需要减少液体蒸发时（如在非加湿的显微镜载物台上进行长时间成像实验），使用盖子的锁扣功能 。但在细胞培养箱内正常培养时，无需一直使用锁扣，以免影响气体交换 。
避免底部刮擦：在操作培养皿过程中，注意避免尖锐物品刮擦底部，尤其是用于高分辨率成像的聚合物盖玻片底部或玻璃底部，刮擦可能会导致底部光学性能下降，影响成像质量 。拿取培养皿时，应手持培养皿侧壁，避免接触底部 。
特殊表面使用注意：对于 bioinert 表面的培养皿，由于其阻止细胞粘附的特性，在加入细胞悬液后，尽量减少培养皿的移动和晃动，以免细胞聚集体分散 。同时，该表面不能进行额外的蛋白包被等处理，需严格按照其适用范围使用 。
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