如何解读Qubit RNA IQ Assay Kit的检测结果?
Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 是一种用于精确检测 RNA 质量和浓度的工具,以下是对其检测结果解读的一些要点:
浓度
数值含义:检测结果会给出 RNA 的浓度值,单位通常是 ng/μL。这个数值表示每微升样品中所含 RNA 的质量。
准确性:Qubit 系统采用荧光染料特异性地结合 RNA,能提供高精度的定量结果,受杂质干扰小,比传统的紫外分光光度法更准确。例如,若紫外分光光度法检测结果受蛋白质等杂质影响而偏高,Qubit RNA IQ Assay Kit 则能排除此类干扰,给出更真实的 RNA 浓度值。
RNA 完整性数(RIN)
数值范围与意义:RIN 值范围从 1 到 10,10 代表最完整的 RNA,通常认为 RIN 值≥7 表示 RNA 质量较好,适用于大多数下游应用,如 qRT - PCR、微阵列分析等;RIN 值在 5 - 7 之间,说明 RNA 有一定程度的降解,但可能仍适用于一些对 RNA 完整性要求不太高的实验,如普通 RT - PCR;RIN 值<5 则表明 RNA 降解严重,可能会影响实验结果的准确性和可靠性。
评估方法:该试剂盒通过分析 RNA 电泳图谱中 28S 和 18S rRNA 的相对强度以及它们与其他 RNA 条带的分布情况来计算 RIN 值,能直观地反映 RNA 的完整性。
28S/18S 比值
正常范围:对于真核生物,完整的 RNA 通常具有 28S/18S 比值在 1.8 - 2.2 之间。
比值变化含义:比值高于 2.2 可能表示 RNA 有降解,导致 18S rRNA 丢失相对较多;比值低于 1.8 可能意味着存在 RNA 的部分降解或污染,例如,可能有基因组 DNA 污染,影响了 28S rRNA 的条带强度,或者 RNA 在提取过程中受到了机械剪切力等因素的影响,使 28S rRNA 断裂,从而降低了该比值。
在解读检测结果时,需要综合考虑浓度、RIN 值和 28S/18S 比值等多个指标,以全面评估 RNA 的质量和浓度是否满足实验需求。同时,还应结合实验目的和后续应用来判断 RNA 样品是否合格。例如,对于构建 cDNA 文库,通常需要高质量、高浓度且完整性好的 RNA,即 RIN 值较高、28S/18S 比值正常且浓度足够的样品;而对于一些简单的基因表达分析实验,对 RNA 质量的要求可能相对宽松一些。