Western 及 IP 裂解液的使用方法与实验结果的准确性和可靠性紧密相关,规范操作并注意关键细节,才能充分发挥其性能。下面从使用方法和注意事项两方面为你详细介绍:
实验前准备
样本收集:根据实验需求收集细胞或组织样本。对于细胞样本,贴壁细胞需先用 PBS 缓冲液轻柔洗涤 2 - 3 次,去除培养基残留;悬浮细胞则通过离心(通常 500 - 1000 rpm,3 - 5 分钟)收集,并用 PBS 重悬洗涤。组织样本需在预冷的生理盐水中清洗,去除血液等杂质,并用干净的剪刀或刀片将其剪碎成小块。
裂解液准备:从低温储存环境(-20℃或 4℃,根据产品说明)取出裂解液,平衡至室温。若裂解液中蛋白酶抑制剂、磷酸酶抑制剂等为单独包装,需在使用前按照说明准确添加到裂解液中,并充分混匀。
样本裂解
细胞样本裂解:对于贴壁细胞,可直接在培养板中加入适量裂解液(通常每 1×10⁶个细胞加入 100 - 200 μL 裂解液),轻轻摇晃培养板使裂解液均匀覆盖细胞表面,然后置于冰上,通过温和振荡(如涡旋振荡器,低速振荡 1 - 2 分钟)或超声处理(30 秒超声,间隔 30 秒,重复 3 - 5 次,超声功率需根据细胞类型调整)进行裂解。悬浮细胞则需先离心去除 PBS,再加入裂解液,同样在冰上进行振荡或超声处理。
组织样本裂解:将剪碎的组织样本转移至预冷的匀浆器或离心管中,按照每 100 mg 组织加入 500 - 1000 μL 裂解液的比例添加裂解液。先使用机械匀浆器进行初步匀浆,使组织破碎,然后结合超声处理进一步裂解细胞,确保蛋白质充分释放。
蛋白质提取
裂解液储存与保质期
操作过程中的细节把控
低温操作:整个样本裂解和处理过程应尽量在冰上或 4℃环境中进行,以降低细胞内蛋白酶的活性,减少蛋白质的降解。特别是对于一些不稳定或易降解的蛋白质,低温操作尤为重要。
避免交叉污染:使用无菌的移液器枪头、离心管等实验器具,避免不同样本之间的交叉污染。同时,在添加裂解液、吸取上清等操作时,要小心谨慎,防止液体溅出污染其他样本或实验环境。
裂解条件优化:不同的细胞类型和组织样本对裂解条件的要求可能不同,需根据实际情况优化裂解时间、超声功率、振荡强度等参数。例如,对于一些细胞壁较厚的植物细胞或坚韧的组织样本,可能需要适当延长裂解时间或提高超声功率,但也要避免过度裂解导致蛋白质结构破坏。
与后续实验的兼容性
成分兼容性:确保裂解液中的成分不会对后续实验产生干扰。例如,若后续要进行蛋白质纯化(如亲和层析、离子交换层析),裂解液中的高浓度盐、去垢剂等成分可能影响纯化效果,需进行适当的透析、稀释或更换缓冲液等处理。若进行质谱分析,需注意裂解液中的某些添加剂可能会影响质谱检测,应选择质谱兼容的裂解液或进行样品预处理。
实验体系匹配:根据后续实验目的选择合适的裂解液。若进行 Western Blot 实验,需保证裂解液能够使蛋白质充分变性;若进行 IP 实验,则要选择能够保持蛋白质天然构象的温和型裂解液,以确保蛋白质 - 蛋白质相互作用不被破坏。