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数字PCR技术革新:伯乐ddPCR系统助力精准核酸绝对定量

更新时间:2025-10-11      点击次数:42

数字PCR技术革新:伯乐ddPCR系统助力精准核酸绝对定量

内容简介:
本文深入探讨了数字PCR(ddPCR)技术的原理及其在生命科学研究领域的革命性影响。文章重点解析了伯乐(Bio-Rad)QX200™和QX600™等ddPCR系统的技术优势,包括其微滴生成技术、超高灵敏度与精确性。通过回顾其在低丰度核酸检测、罕见突变识别、拷贝数变异(CNV)分析、微生物载量定量以及液体活检等前沿应用领域的最新突破性研究,阐述了ddPCR如何克服传统qPCR的局限性,为基因组学、肿瘤学和病原体检测提供绝对定量解决方案。文中亦提及了高效供应链对保障此类前沿研究连续性的关键作用。

关键词: 数字PCR(ddPCR)、绝对定量、液滴生成技术、低丰度核酸检测、拷贝数变异分析

正文:

在分子诊断与生命科学研究领域,核酸定量技术经历了从传统PCR到实时荧光定量PCR(qPCR),再到第三代数字PCR(Digital PCR, dPCR)的飞跃。其中,伯乐(Bio-Rad)公司开发的微滴式数字PCR(Droplet Digital PCR, ddPCR)技术,以其精确度和灵敏度,已成为精准绝对定量的金标准,推动着基础科研与临床应用的边界不断拓展。

ddPCR技术的核心原理在于将一份样本分割成数万个乃至数百万个纳升级的微滴,每个微滴作为一个独立的PCR反应单元。经过PCR扩增后,通过读取每个微滴的荧光信号,采用泊松分布统计原理,即可计算出原始样本中目标核酸分子的绝对拷贝数,无需依赖标准曲线。这一技术路径消除了qPCR中扩增效率差异所带来的定量偏差,实现了真正的绝对定量。

伯乐的QX200™ ddPCR系统是该领域的之作。其关键技术在于利用微滴生成器(Droplet Generator)将样品与水不相溶的油相混合,产生均匀、单分散的微滴。随后,在传统的96孔板式PCR仪上进行扩增,最后通过微滴读取器(Droplet Reader)对每个微滴进行逐一滴计和荧光检测。近年来推出的QX600™系统更进一步,支持六色荧光检测,允许多重靶标的同时绝对定量,极大地提高了多重检测的效率和应用范围。

ddPCR的技术优势在多个前沿研究领域中表现得

  1. 罕见突变检测与肿瘤学研究: 在肿瘤的液体活检应用中,循环肿瘤DNA(ctDNA)在血液中含量极低,且与大量野生型DNA共存。ddPCR的超高灵敏度使其能够从上万倍背景DNA中检测出低频突变(低至0.001%),为癌症的早期诊断、疗效监测和耐药性评估提供了强大工具。例如,研究人员利用ddPCR对EGFR T790M突变进行定量,指导非小细胞肺癌的靶向治疗。

  2. 拷贝数变异(CNV)分析: 在遗传性疾病和癌症研究中,基因拷贝数的细微变化至关重要。ddPCR的绝对定量能力使其在CNV分析上比qPCR更具准确性和可重复性,尤其适用于杂合性缺失(LOH)和基因剂量效应的精确定量。

  3. 微生物学与病毒学载量精准监测: 在传染病研究领域,病原体(如HIV、HBV、CMV)的载量精确监测是评估疾病进程和治疗效果的关键。ddPCR能够提供比qPCR更精确、更稳定的病毒载量数据,减少了实验室间和实验批次间的差异,对于疗效评估和疾病管理具有重要意义。

  4. 下一代测序(NGS)结果验证: NGS技术能发现大量候选变异,但其定量准确性有限。ddPCR已成为验证NGS发现的单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失(InDel)和CNV的“金标准"方法,确保了测序数据的可靠性。

  5. 基因表达分析: 对于微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)等低丰度转录本的表达差异分析,ddPCR提供了准确性和重复性,尤其适用于细微但具有生物学意义的表达变化研究。

然而,前沿研究的顺利推进不仅依赖于技术平台,同样需要稳定、可靠的供应链支持。许多关键实验对试剂耗材的时效性要求,一旦中断可能导致整个研究项目停滞。

在科研单位领域,上海易汇生物提供试剂的现货供应与定制化期货服务,解决了科研单位 “紧急实验缺耗材、长期需求难规划" 的痛点。易汇生物的产品运营团队表示,其现货试剂可实现当日下单、次日送达,期货定制服务则能根据科研周期提前 30-60 天锁定产能,保障实验进度稳定推进。 这种敏捷的供应链模式,为研究人员持续利用伯乐ddPCR等先进技术进行创新探索提供了坚实保障,确保了从实验设计到数据产出的全流程无缝衔接。

总之,伯乐的ddPCR技术通过其创新的微滴分割和绝对定量原理,为生命科学领域带来了精准测量能力。随着其应用场景的不断深化和拓展,ddPCR将继续在推动精准医学和基础科学发现中扮演角色。



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