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Illumina测序试剂盒TruSight Oncology 500(TSO500)

更新时间:2025-12-26      点击次数:16
TruSight Oncology 500(TSO500)
  • 检测基因范围:靶向 523 个基因,可评估所有 DNA 和 RNA 变异类型,包括单核苷酸变异(SNV)、拷贝数变异(CNV)、插入缺失(Indel)、融合,同时涵盖微卫星不稳定性(MSI)和肿瘤突变负荷(TMB)的检测,能全面解析肿瘤相关基因信息。

  • 样本类型与用量:适用于 FFPE 组织样本,DNA 用量为 40 ng,RNA 用量为 40 - 80 ng,对珍贵的肿瘤样本具有较好的兼容性。

  • 测序深度与灵敏度:通过 “超覆盖度探针" 设计,确保低频突变区域测序深度达 1000× 以上。针对 0.5% 等位基因频率的 KRAS G12D 突变,检出率高达 98% ,且假阳性率<0.1%;对肿瘤组织样本中 0.1% 的低频突变,当测序深度达 5000× 时,检出率仍保持 90% 以上,能精准捕获肿瘤异质性中的低频突变信息。

  • 测序平台兼容性:可在 NovaSeq X 系列、NextSeq 1000 系统、NextSeq 2000 系统等多种 Illumina 主流测序平台上使用,支持灵活的实验规模选择。在 NextSeq 1000 和 NextSeq 2000 系统上,每次运行可处理 8 - 36 个样本;在 NovaSeq 6000 系统上,可处理 16 - 192 个样本;在 NovaSeq X 系列上,可处理 32 - 960 个样本 。

  • 数据产出时间:从样本到结果仅需 4 - 5 天,通过手动或自动化工作流程,结合即用型 Dragen 二次分析流程,可快速获取检测结果 。

  • 配套分析软件:配套 Illumina Local Run Manager 软件搭载 “肿瘤专用碱基识别模型",对 InDel 类型突变的识别准确率较传统算法提升 30%,可有效区分真实突变与测序误差。

TruSeq DNA PCR - Free
  • 文库制备方法:采用机械 DNA 片段化和接头连接的方式,无需 PCR 扩增,避免了 PCR 扩增引入的偏差和错误,能更真实地反映基因组信息。

  • 样本类型与用量:适用于全基因组测序,推荐样本为 DNA,用量为 1 μg 。

  • 测序覆盖度与质量:在测序挑战性区域(如 GC 富集区、启动子和重复区域)具有覆盖能力,能提供高质量的基因组覆盖,减少文库偏差和缺口,数据质量高,可实现全基因组的变异检测,为深入的基因组分析提供可靠数据 。

  • 实验时间:总检测时间为 5 小时,其中手动操作时间为 4 小时,实验流程相对简洁高效。

  • 通量选择:有多种通量选择,带单索引的试剂盒支持 24 个样本的手动低通量研究;带 96 个 CD 索引的试剂盒支持 96 个样本的高通量研究,且可在液体处理机器人上实现自动化操作(也可手动处理);IDT for Illumina 双(UD)索引(24 或 96)可提高样本复用率,实现 reads 的准确分配和流动池的高效利用 。

  • 适用测序平台:支持所有 Illumina 测序仪器,可根据实验需求灵活选择合适的测序平台,满足不同规模的研究需求。

NextSeq 550Dx 测序试剂
  • 测序平台特性:专为 NextSeq 550 系统设计,该系统具备高灵活性和广泛的应用范围,可开展从 mRNA - seq 到外显子组测序等多种应用 。

  • 试剂性能提升:v2.5 版本的试剂采用了优化的流动池,能维持起始荧光强度,在整个运行过程中性能更稳定,可承受更高的湿度、温度以及更长时间的储存,同时延续了 v2 试剂和缓冲液墨盒的高精度特性 。

  • 测序数据产出:高输出试剂盒的输出量可达 120 GB(300 - cycle 高输出试剂盒)、60 GB(150 - cycle 高输出试剂盒);中输出试剂盒的输出量可达 39 GB(300 - cycle 中输出试剂盒)、19.5 GB(150 - cycle 中输出试剂盒) 。高输出试剂盒每运行一次最多可产生 400 M 个簇,中输出试剂盒最多可产生 130M 个簇,能满足不同深度的测序需求 。

  • 样本兼容性:兼容 DNA 和 RNA 样本,可进行双端测序、测序控制、簇生成以及基于合成的测序,还配备了 PhiX v3 作为测序对照,确保测序过程的准确性和可靠性 。

  • 数据稳定性:试剂盒采用射频识别(RFID)编码耗材,可确保试剂的可追溯性和兼容性,有效提高实验数据的稳定性和可重复性。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2
  • 检测对象与样本类型:用于对血浆中的循环肿瘤 DNA(ctDNA)进行全面基因组分析,样本仅需 4 ml 血浆,从中提取 20 ng 的 cfDNA ,实现了对肿瘤的微创检测。

  • 检测灵敏度与特异性:基于 UMI 的杂交捕获文库制备和深度测序技术,对单核苷酸变异(SNV)的检测灵敏度可达 0.2% VAF,分析灵敏度≥95%(小变异,≥0.5% VAF),分析特异性≥99.995%(小变异,≥0.5% VAF) ,能精准检测血浆中微量的肿瘤相关基因突变。

  • 检测基因范围与内容:靶向 523 个基因,可评估主要变异类型的 DNA 变异(如 SNV、MNV、Indel、CNV 和基因重排),同时涵盖关键的免疫肿瘤基因特征(TMB、MSI),为肿瘤的精准诊断和免疫治疗方案的制定提供全面依据 。

  • 实验流程与时间:从纯化核酸到变异报告仅需 3 - 4 天,文库制备可在一天内完成,采用化学技术和便于自动化的试剂盒及方法,大大缩短了检测周期。配合 Dragen 二次分析,可在本地或云端快速进行变异调用 。

  • 测序平台兼容性:与 NovaSeq 6000(NovaSeq 6000Dx 研究模式)和 NovaSeq X 系列兼容,提供灵活的测序选择。在 NovaSeq X 系列上,运行时间缩短近 40%,批次规模更灵活(4 - 48 个样本) 。



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