染料结合机制:该试剂盒使用了两种的荧光染料 。一种染料能够特异性地与大的、完整的和 / 或高度结构化的 RNA,如 mRNA、tRNA、rRNA 相结合;另一种染料则选择性地与小的 RNA 和 / 或降解的 RNA 结合。当这两种染料与 RNA 样品混合后,会根据 RNA 的大小和完整性与相应的 RNA 片段结合。在 Qubit 4 或 Qubit Flex 荧光计的激发下,结合了染料的 RNA 会发出荧光信号,仪器通过检测荧光信号的强度和比例,来判断 RNA 样品的质量和完整性。
精准的信号分析算法:Qubit 4 荧光计和 Qubit Flex 荧光计内置了专门的算法 ,能够对检测到的荧光信号进行精确分析。通过对比两种染料所产生的荧光强度,计算出样品中大小 RNA 的比例,进而得出一个 RNA IQ 编号(RNA IQ#)。这个编号类似于其他 RNA 质量评分系统,取值范围为 1 至 10。其中,较小的数值表明样品主要由小 RNA 组成,可能存在 RNA 降解的情况;较大的数值则表明样品主要由大 RNA 或具有三级结构的 RNA 组成,RNA 的完整性和质量较高。
快速高效:使用 Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 进行 RNA 质量检测非常迅速 。科研人员只需将 RNA 样品加入到 RNA IQ 工作溶液中,然后在 Qubit 4 或 Qubit Flex 荧光计上进行测量,短时间内即可获得检测结果。相较于传统的电泳方法,如凝胶电泳或基于微流体的电泳,该试剂盒大大缩短了检测时间。例如,使用凝胶电泳检测 RNA 完整性,从制胶、加样到跑胶、观察结果,往往需要数小时;而使用本试剂盒,整个检测过程可能仅需几分钟,显著提高了实验效率。
操作简便:整个检测过程无需复杂的样品预处理步骤或特殊的实验技能 。科研人员只需按照试剂盒说明书的指引,将适量的样品与工作溶液混合均匀,然后放入荧光计中检测即可。无需像传统电泳方法那样,进行繁琐的凝胶制备、样品染色等操作,减少了人为误差的引入,使得实验操作更加标准化和便捷。即使是刚接触 RNA 质量检测的科研人员,也能在短时间内熟练掌握该试剂盒的使用方法。
结果准确可靠:该试剂盒的检测结果与传统的电泳方法具有良好的相关性 。其采用的双染料结合机制和精准的信号分析算法,能够准确区分完整的 RNA 和降解的 RNA,为科研人员提供可靠的 RNA 质量评估结果。同时,该试剂盒在检测过程中,对常见的干扰物质,如盐类、蛋白质、溶剂以及 RNA 稳定试剂等具有较好的耐受性,即使样品中存在这些物质,也能准确评估 RNA 的质量,避免了因杂质干扰而导致的误判。
信号稳定性好:试剂盒产生的荧光信号在 1 小时内保持稳定 。这意味着科研人员在完成样品与工作溶液的混合后,有足够的时间进行多次测量或对多个样品进行依次检测,无需担心信号衰减对结果准确性的影响。这种良好的信号稳定性,进一步保证了实验结果的可靠性和可重复性。
二代测序(NGS):在二代测序实验中,RNA 的质量直接影响测序数据的质量和准确性 。使用 Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 对 RNA 样品进行质量评估,可以确保进入测序流程的 RNA 是高质量、完整的,从而提高测序文库的构建效率,减少测序过程中的错误和偏差,为后续的生物信息学分析提供可靠的数据基础。例如,在转录组测序中,高质量的 RNA 能够更准确地反映细胞内的基因表达情况,帮助科研人员发现新的基因转录本和表达差异基因。
RNA 测序(RNA-Seq):与二代测序类似,RNA-Seq 实验对 RNA 的质量要求也很高 。通过该试剂盒评估 RNA 质量,能够筛选出适合进行 RNA-Seq 的样品,避免因 RNA 降解而导致的测序数据丢失或不准确。对于研究基因表达调控、转录后修饰等方面的科研工作,准确的 RNA-Seq 数据至关重要,而 Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 为获得高质量的 RNA-Seq 数据提供了有力保障。
基因表达分析:无论是使用实时定量 PCR(qPCR)还是基因芯片等技术进行基因表达分析,RNA 的完整性都会影响实验结果的准确性 。使用该试剂盒检测 RNA 质量,能够确保用于基因表达分析的 RNA 样品具有良好的质量,从而使检测到的基因表达水平更真实地反映细胞的生理状态。例如,在研究疾病发生发展过程中的基因表达变化时,准确的 RNA 质量评估能够帮助科研人员更准确地判断基因表达的差异,为揭示疾病的发病机制提供可靠依据。
其他 RNA 相关研究:在 RNA 干扰(RNAi)实验、体外转录实验等其他涉及 RNA 的研究中,RNA 的质量同样会对实验结果产生重要影响 。Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 可用于这些实验前的 RNA 质量筛选,保证实验材料的可靠性,提高实验的成功率。例如,在 RNAi 实验中,高质量的 RNA 能够更有效地介导基因沉默,增强实验效果;在体外转录实验中,完整的 RNA 模板能够提高转录产物的产量和质量。
样本准备:使用试剂盒前,需准备适量的 RNA 样品 。确保样品的浓度在试剂盒的检测范围内,一般来说,建议样品浓度为 0.5 - 1.5 μg/μL。如果样品浓度过高或过低,可能会影响检测结果的准确性。对于浓度不符合要求的样品,可通过适当的稀释或浓缩处理进行调整。同时,要保证样品的纯度,尽量减少蛋白质、盐类等杂质的污染,以获得更准确的检测结果。
试剂准备:从试剂盒中取出所需的试剂,包括 RNA IQ 工作溶液等 。在使用前,需将试剂平衡至室温,并轻轻混匀,避免产生气泡。注意按照说明书的要求,正确配制工作溶液,确保试剂的有效性。同时,要注意试剂的保存条件,未使用完的试剂应及时放回冰箱中保存,避免反复冻融,影响试剂性能。
实验操作流程:将准备好的 RNA 样品与 RNA IQ 工作溶液按照 1:19 的比例混合均匀 ,例如,取 1 μL 的 RNA 样品加入到 19 μL 的 RNA IQ 工作溶液中。混合后,将溶液转移至 Qubit 4 荧光计专用的 500 μL 薄壁 PCR 管(货号 Q32856)中,或者 Qubit Flex 荧光计专用的 8 x 200 μL 管条(货号 Q33252)中。然后,将装有样品的管放入对应的荧光计中,按照仪器的操作指南进行检测。荧光计会自动读取荧光信号,并计算出 RNA IQ 编号以及样品中大小 RNA 的百分比。
结果解读:检测完成后,荧光计会显示出 RNA IQ 编号(RNA IQ#)以及样品中大小 RNA 的计算百分比 。如前文所述,RNA IQ# 取值范围为 1 至 10,数值越大,表明 RNA 的质量和完整性越好。科研人员可根据这个编号以及实验的具体需求,判断 RNA 样品是否适合进行后续实验。同时,结合大小 RNA 的百分比,能够更全面地了解 RNA 样品的组成情况,为实验方案的调整提供参考。
存储条件:为保证试剂盒的性能,应将其储存于 -20°C 或更低温度 。RNA 标准品则需储存于 -80°C 或更低温度。在储存过程中,要注意避免试剂盒受到光照和潮湿环境的影响。开封后的试剂盒应尽快使用,并妥善保存剩余部分,防止试剂污染。在有效期内使用试剂盒,以确保实验结果的可靠性。若发现试剂盒中的试剂出现浑浊、沉淀或颜色异常等情况,请勿使用。