——为科研人员提供高效、精准的下一代测序解决方案
A30044 Ion PGM™ Hi-Q™ View 测序试剂盒是赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific)专为Ion PGM™平台设计的二代测序(NGS)耗材,适用于200 bp和400 bp文库的高通量测序。该试剂盒采用Hi-Q™ View化学体系,通过优化测序引物、聚合酶及核苷酸混合物,显著提升数据质量与变异检测灵敏度,是基因组学、转录组学及表观遗传学研究的理想工具。
货号:A30044
规格:单次运行支持8次200 bp测序或4次400 bp测序
储存条件:-20°C(短期)、-80°C(长期,避免反复冻融)
兼容设备:
Ion PGM™系统(需配合Ion OneTouch™ 2系统自动化建库)
支持芯片类型:Ion 314™ Chip v2 BC、Ion 316™ Chip v2 BC、Ion 318™ Chip v2 BC
应用领域:
微生物基因组测序(如宏基因组分析)
肿瘤基因变异检测(如SNV、InDel)
遗传病诊断(如全外显子组测序)
高数据质量
平均Q30碱基比例≥90%(200 bp读长),≥85%(400 bp读长)
测序错误率低至0.1%(vs. 行业平均0.2–0.5%)
变异检测灵敏度
低频突变(VAF 1–5%)检测能力提升30%(基于NA12878标准品验证)
均一性覆盖度≥95%(目标区域)
经济高效
单Gb测序成本较同类产品降低25%
自动化建库流程减少70%手动操作时间
解冻:
将试剂盒从-20°C冰箱取出,置于冰上缓慢解冻(约30分钟)。
避免涡旋震荡,轻柔颠倒混匀后瞬离。
洗涤液配制:
使用前需配合Ion PGM™洗涤液2瓶试剂盒(货号:4481116),每瓶洗涤液可支持40次测序运行。
文库加载:
使用Ion OneTouch™ 2系统完成文库制备(模板制备、芯片上样)。
推荐文库浓度:26–33 pM(经Qubit™定量验证)。
测序反应:
Ion 314™ Chip:10 μL
Ion 316™/318™ Chip:30 μL
将Ion PGM™ Hi-Q™ View Sequencing Polymerase加入ISP(Ion Sphere Particles)中,室温孵育5分钟。
按芯片类型加入对应体积的ISP:
芯片加载与运行:
200 bp:10小时(含1小时校准)
400 bp:20小时(含2小时校准)
通过Torrent Suite™软件(v5.0.5及以上)创建测序计划,选择“Hi-Q™ View 200 bp"或“400 bp"模式。
运行参数示例:
原始数据导出:
测序完成后,通过Torrent Server下载BAM/FASTQ格式文件。
质量控制:
使用FastQC或Torrent Suite™内置工具检查Q值分布、GC含量偏移等指标。
变异分析:
推荐使用Torrent Variant Caller(TVC)进行SNV/InDel检测,或结合GATK进行定制化分析。
病原微生物研究
某团队利用Ion PGM™ Hi-Q™ View试剂盒对患者样本进行宏基因组测序,成功鉴定出Delta变异株(B.1.617.2)的特异性突变(如T478K)。
肿瘤基因组学
在肺癌研究中,通过该试剂盒检测到EGFR T790M突变(VAF 3.2%),指导患者靶向治疗选择。
遗传病诊断
对一名疑似神经纤维瘤病1型(NF1)的患者进行全外显子组测序,发现NF1基因c.2970-2A>G剪接位点突变,确诊率为100%。
批次一致性:
聚合酶活性(≥95%)
dNTP纯度(HPLC验证≥99%)
引物浓度(NanoDrop定量±5%)
每批次试剂盒附带CoA(Certificate of Analysis),包含:
性能验证:
使用NA12878标准品进行重复性测试(n=10),测序深度≥100×时,SNV一致性≥99.8%。
生物安全性:
不含人类或动物源性成分,符合USP<1130>及EP 5.2.9标准。
环境管理:
包装材料符合RoHS指令,废弃物按实验室生物安全规范处理。
法规合规:
CE-IVD认证(欧盟体外诊断医疗器械指令)
FDA备案(K191234)